WebNov 10, 2024 · SeuratObject: Data Structures for Single Cell Data. Defines S4 classes for single-cell genomic data and associated information, such as dimensionality reduction embeddings, nearest-neighbor graphs, and spatially-resolved coordinates. Provides data access methods and R-native hooks to ensure the Seurat object is familiar to other R … Web想在R中进行单细胞测序数据的多样本整合分析，将不同单细胞测序样本整合成一个数据集，整合方法可以用来将数据对齐并整合成一个大型数据矩阵。以下是使用Seurat 包中的Integration方法（占内存大，可用Harmony方法…
读入csv文件的表达矩阵成为Seurat对象（CNS图表复 …
WebFeb 19, 2024 · 最近自己写的简书文章太多了，导致很难找到之前写的文章。 于是，我想整理一篇目录，使用搜索快捷键：ctrl+F，即可... WebR语言，Seuratobject，想要实现多个小提琴图在一个图的效果，想要实现的效果如下所示：其中，rotate_x_text()转置横坐标的字体，ggpubr包 PDF和图片怎样合并在一起. 有时我们需要把一些图片和PDF文件整理到同一个文件中，是否有直接合并的方法呢？ initiative feat 5e
关于r：将元数据添加到Seurat对象 码农家园
WebSeuratObject Defines S4 classes for single-cell genomic data and associated information, such as dimensionality reduction embeddings, nearest-neighbor graphs, and spatially-resolved coordinates. Provides data access methods and R-native hooks to ensure the Seurat object is familiar to other R users. Web我想知道是否有人知道如何检查修改后的Seurat对象以确认元数据已添加到正确的插槽和列中。. 要添加元数据，我使用了以下命令。. 首先，我从侦探对象中提取了单元名称. 1. > Cells <- WhichCells (sleuth_object) 然后，我使用数字1-3创建了一个由形态确定的细胞类型的 ... WebMar 19, 2024 · 您可以通过以下方式从 Seurat 对象 my_object 中检索表达基因 my_gene 的细胞数量：. sum (GetAssayData (object = my_object, slot = "data") [my_gene,]>0) 表达该基因的细胞百分比为：. sum (GetAssayData (object = my_object, slot = "data") [my_gene,]>0)/nrow ( [email protected]) 对象 [email protected] 可用于 ... initiative ffx